Este estudo tem por objetivo analisar as relações de construção e contribuição entre a Metodologia da Autoavaliação Institucional — MAAI e a Gestão Pedagógica de Projetos em Educação a Distância — EAD. A MAAI pode ser definida como um conjunto de procedimentos sistematizados, voltados à análise e desenvolvimento dos componentes, agentes e processos que constituem a gestão pedagógica de projetos na EAD. Para entendimento teórico, a presente pesquisa investiga conceitos, origem e história da Avaliação Institucional, com foco nas IES brasileiras e na regulação da modalidade EAD. Também revisa fundamentos que identifiquem a complexidade da gestão pedagógica da educação on-line e a importância de concebermos um instrumento com foco no aperfeiçoamento contínuo de elementos da didática da aprendizagem. A sequência da pesquisa descreve a MAAI como é proposta, relata sua origem e evolução, apresenta as suas etapas, os processos e enumera os resultados obtidos com o uso sistemático da MAAI nos cursos de graduação na UnisulVirtual, campus virtual da Universidade do Sul de Santa Catarina. A análise toma como objeto de estudo, mais especificamente, a aplicação da MAAI no Curso de Graduação a Distância em Administração. A finalidade é criar oportunidade para observar o uso da MAAI, avaliar o seu potencial como instrumento de aperfeiçoamento contínuo e inovação da gestão pedagógica de projetos em EAD, reconhecer dificuldades e sucessos. A análise tem como proposta ampliar a compreensão sobre o uso dessa metodologia na gestão pedagógica de projetos em EAD e indicar caminhos para a evolução de instrumentos de avaliação e de gestão de cursos on-line. O referencial teórico-metodológico adotado é o da pesquisa qualitativa baseada nos pressupostos da análise de conteúdos e do método crítico-dialético.